Charles Darwinin kansallispuisto on Australian Pohjoisterritoriossa sijaitseva vuonna 1998 perustettu kansallispuisto. Se sijaitsee 4 kilometriä kaakkoon Darwinistä.
Kansallispuiston alueelta löytyy useita toisen maailmansodan aikaisia betonibunkkereita, joista yksi on muutettu matkailijakeskukseksi ja toisen maailmansodan aikaisten tavaroiden näyttelytilaksi. Kansallispuistossa on myös useita hyviä näköalapaikkoja, joista näkee Darwinin kaupungin.